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T/HNSBSXH 02-2025 农业本体网络构建技术规范

  • 名  称:T/HNSBSXH 02-2025 农业本体网络构建技术规范 - 下载地址1
  • 类  别:团体标准规范
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资料介绍

以下是《农业本体网络构建技术规范》(T/HNSBSXH 02-2025)的详细内容总结:


​一、标准基本信息​

  • ​标准编号​​:T/HNSBSXH 02-2025
  • ​归口单位​​:海南省博士协会
  • ​起草单位​​:中国农业科学院农业信息研究所、三亚中国农业科学院国家南繁研究院
  • ​适用范围​​:农业本体网络的构建、管理及分析。

​二、核心术语定义​

  1. ​农业本体​
    • 农业领域概念体系的正式规范说明,需明确、一致。
  2. ​农业本体关系​
    • 定义实体间关联(单向/双向),如继承、部分整体等关系。
  3. ​农业本体网络​
    • 通过联结多套本体中的术语关系图,构建跨领域语义网络,支持知识融合。
  4. ​农业本体推理​
    • 基于本体语义逻辑推断实体类型及关系。
  5. ​农业本体网络系统​
    • 以本体为核心的知识管理系统,实现语义化建模与互操作。

​三、构建原则​

  1. ​准确性​​:真实反映农业科学实际。
  2. ​一致性​​:概念与关系逻辑自洽。
  3. ​可扩展性​​:支持新增概念或关系。
  4. ​互操作性​​:兼容其他系统或本体。

​四、农业本体数据要求​

​5.1 数据类别​​(3大类28个本体)

​类别​ ​代表本体​
​生物信息类​ 基因本体(GO)、蛋白质本体(PRO)、细胞本体(CL)等11项,格式主要为OBO。
​农业实体类​ 植物本体(PO)、环境本体(ENVO)、食品本体(FOODON)等12项,含OWL/OBO格式。
​农业性状表型类​ 植物胁迫本体(PSO)、畜产品性状本体(LPT)等5项。

​5.2 数据格式​​(19项属性)

​属性​ ​说明​
Vertex_ID 术语唯一编号
name/namezh 术语中英文名称
def/defzh 中英文定义
synonym 同义词
is_obsolete 是否过时
xref 外部参照(跨本体链接)
property_value 自定义属性值

​5.3 数据关系​​(14种基础关系)

​关系类型​ ​代表关系​ ​说明​
继承关系 is_a/subClassOf 子类继承父类属性(如"A是B的子类")
部分整体关系 part_of/has_part 描述组成部分(如"叶片属于植物")
调节关系 regulates 正向/负向调控(如"基因调控表达")
不相交关系 disjointWith 概念无交集(如"动物与植物不相交")

​五、农业本体数据推理​

​6.1 基础关系推理​

  • ​依据关系​​:is_a, part_of, has_part, regulates
  • ​推理规则​​:
    • 传递性(如 A is_a B + B part_of CA part_of C)。
    • 禁止矛盾组合(如 has_part 不与 part_of 传递)。
  • ​步骤​​:读取三元组→应用规则→结果去重。

​6.2 分级相关性关系推理​

  • ​相关性证据​​(5类):
    1. 定义相关(术语定义中引用);
    2. 语义相关(语义解释相似);
    3. 生物网络相关(生物路径关联);
    4. 功能特性相关(同父类且特性相似);
    5. 参考物种相关(实验验证)。
  • ​分级规则​​(4级):
    ​级别​ ​要求​ ​推理规则​
    I级相关 ≥3类证据 I级 + I级 → I级
    II级相关 2类证据 I级 + II级 → II级
    III级相关 仅定义相关 III级 + I级 → II级
    IV级相关 单证据(非定义相关) 不参与传递推理

​六、农业本体网络管理及可视化​

​7.1 系统功能​

  • ​自动化导入​​:解析OBO/OWL格式,生成顶点、边、图模型文件。
  • ​自动化推理​​:支持大规模基础关系与分级相关性推理。
  • ​可视化​​:图形化展示网络拓扑,支持节点/边信息查询。
  • ​管理功能​​:本体关系的增删改查。

​七、参考文献​

  • 国际标准:ISO/IEC 21838-1:2021(顶层本体规范)。
  • 学术文献:《农业本体论研究与应用》《基于OWL的本体推理研究》等。
  • 技术白皮书:Ontology Infrastructure White Paper (2019)。

​核心价值总结​

  1. ​标准化​​:统一农业本体数据格式与关系类型,促进跨系统互操作。
  2. ​智能化​​:通过分级推理机制,实现语义关联的自动化扩展。
  3. ​系统化​​:构建"导入-推理-可视化-管理"全流程技术体系。
  4. ​领域适配​​:覆盖生物信息、农业实体、性状表型三大核心场景。

此规范为农业知识图谱构建提供了方法论基础,推动农业大数据向语义化、智能化发展。

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