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T/HNSBSXH 02-2025 农业本体网络构建技术规范
- 名 称:T/HNSBSXH 02-2025 农业本体网络构建技术规范 - 下载地址1
- 类 别:团体标准规范
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资料介绍
以下是《农业本体网络构建技术规范》(T/HNSBSXH 02-2025)的详细内容总结:
一、标准基本信息
- 标准编号:T/HNSBSXH 02-2025
- 归口单位:海南省博士协会
- 起草单位:中国农业科学院农业信息研究所、三亚中国农业科学院国家南繁研究院
- 适用范围:农业本体网络的构建、管理及分析。
二、核心术语定义
- 农业本体
- 农业领域概念体系的正式规范说明,需明确、一致。
- 农业本体关系
- 定义实体间关联(单向/双向),如继承、部分整体等关系。
- 农业本体网络
- 通过联结多套本体中的术语关系图,构建跨领域语义网络,支持知识融合。
- 农业本体推理
- 基于本体语义逻辑推断实体类型及关系。
- 农业本体网络系统
- 以本体为核心的知识管理系统,实现语义化建模与互操作。
三、构建原则
- 准确性:真实反映农业科学实际。
- 一致性:概念与关系逻辑自洽。
- 可扩展性:支持新增概念或关系。
- 互操作性:兼容其他系统或本体。
四、农业本体数据要求
5.1 数据类别(3大类28个本体)
| 类别 | 代表本体 |
|---|---|
| 生物信息类 | 基因本体(GO)、蛋白质本体(PRO)、细胞本体(CL)等11项,格式主要为OBO。 |
| 农业实体类 | 植物本体(PO)、环境本体(ENVO)、食品本体(FOODON)等12项,含OWL/OBO格式。 |
| 农业性状表型类 | 植物胁迫本体(PSO)、畜产品性状本体(LPT)等5项。 |
5.2 数据格式(19项属性)
| 属性 | 说明 |
|---|---|
Vertex_ID | 术语唯一编号 |
name/namezh | 术语中英文名称 |
def/defzh | 中英文定义 |
synonym | 同义词 |
is_obsolete | 是否过时 |
xref | 外部参照(跨本体链接) |
property_value | 自定义属性值 |
5.3 数据关系(14种基础关系)
| 关系类型 | 代表关系 | 说明 |
|---|---|---|
| 继承关系 | is_a/subClassOf | 子类继承父类属性(如"A是B的子类") |
| 部分整体关系 | part_of/has_part | 描述组成部分(如"叶片属于植物") |
| 调节关系 | regulates | 正向/负向调控(如"基因调控表达") |
| 不相交关系 | disjointWith | 概念无交集(如"动物与植物不相交") |
五、农业本体数据推理
6.1 基础关系推理
- 依据关系:
is_a,part_of,has_part,regulates。 - 推理规则:
- 传递性(如
A is_a B+B part_of C→A part_of C)。 - 禁止矛盾组合(如
has_part不与part_of传递)。
- 传递性(如
- 步骤:读取三元组→应用规则→结果去重。
6.2 分级相关性关系推理
- 相关性证据(5类):
- 定义相关(术语定义中引用);
- 语义相关(语义解释相似);
- 生物网络相关(生物路径关联);
- 功能特性相关(同父类且特性相似);
- 参考物种相关(实验验证)。
- 分级规则(4级):
级别 要求 推理规则 I级相关 ≥3类证据 I级 + I级 → I级 II级相关 2类证据 I级 + II级 → II级 III级相关 仅定义相关 III级 + I级 → II级 IV级相关 单证据(非定义相关) 不参与传递推理
六、农业本体网络管理及可视化
7.1 系统功能
- 自动化导入:解析OBO/OWL格式,生成顶点、边、图模型文件。
- 自动化推理:支持大规模基础关系与分级相关性推理。
- 可视化:图形化展示网络拓扑,支持节点/边信息查询。
- 管理功能:本体关系的增删改查。
七、参考文献
- 国际标准:ISO/IEC 21838-1:2021(顶层本体规范)。
- 学术文献:《农业本体论研究与应用》《基于OWL的本体推理研究》等。
- 技术白皮书:Ontology Infrastructure White Paper (2019)。
核心价值总结
- 标准化:统一农业本体数据格式与关系类型,促进跨系统互操作。
- 智能化:通过分级推理机制,实现语义关联的自动化扩展。
- 系统化:构建"导入-推理-可视化-管理"全流程技术体系。
- 领域适配:覆盖生物信息、农业实体、性状表型三大核心场景。
此规范为农业知识图谱构建提供了方法论基础,推动农业大数据向语义化、智能化发展。
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